通常情况下，用手摸头顶有个凹陷，可能是局部皮肤萎缩、头皮血肿、囟门闭合不全等原因引起的，具体分析如下：
1.局部皮肤萎缩：如果患者不注意头顶局部皮肤的护理，可能会导致头顶局部皮肤硬化，容易使头顶局部皮肤逐渐萎缩，进而可能会出现用手摸头顶有个凹陷的情况。患者应注意头顶局部皮肤的护理，选用温和不刺激的洗护用品。
2.头皮血肿：头皮下血管分布比较多，如果患者的头皮受到外伤，如遭受钝性打击或碰撞等，这些外伤都可能会使头皮下的血管破裂，形成血肿，进而可能会出现用手摸头顶有个凹陷的情况。建议患者在医生的建议下通过穿刺、引流等方式进行治疗。
3.囟门闭合不全：正常情况下，囟门会在婴幼儿时期完全会闭合，但在此期间也可能会出现闭合不全的情况，囟门闭合不全，可能会导致患者头顶皮肤凹陷，进而可能会出现用手摸头顶有个凹陷的情况。建议患者在医生的指导下使用复方甘露醇注射液、复方地塞米松凝胶、维生素D3注射液等药物进行治疗。